Adosada al muro exterior de la crujía este; la Sala Capitular (Número 10 en el plano) data de comienzos del S. XIII. Al exterior, cinco arcos de medio punto compuestos de doble arquivolta. De arista las interiores y de bocel las exteriores, que se decoran una sin otra con ajedrezado jaqués. Apean en capiteles con sus columnitas, con decoración geométrica. Las columnitas se agrupan en racimos de cuatro, dando apeo la interior a fajón de sustento de la bóveda de la estancia. Todas ellas se elevan desde una alta basa que en su centro se interrumpe para permitir acceso al interior (Imagen 1).

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Se organiza al interior a modo de cripta cuadrada, con cuatro columnas exentas centrales y doce adosadas, que delimitan nueve espacios cuadrados cubiertos de bóvedas de arista reforzadas con nervaduras y separadas por arcos de medio punto (Imagen 2).

En este lugar reunía el abad a la comunidad para informar; y tras la iglesia era el lugar más solemne del monasterio. En esta sala solían enterrarse los abades. La lápida de alguno de los mismos, adorna el pavimento. También aquí tomaban los hábitos los monjes.

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En el muro norte se halla la sepultura de Lope Ximenez, Señor de la localidad de Agón, realizada en piedra policromada. Data de finales del XIII (Imágenes 3 y 4). En el muro sur, el enterramiento del Abad y Cardenal Sancho Marcilla (Imagen 5), de finales del XIV.