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Durante las obras de restauración, bajo la cabecera del templo se descubrió una cripta que se hallaba colmatada, conteniendo en su centro el sarcófago de una joven dama enterrada en cal, por lo que se conservó el molde de su silueta, ropaje y joyas. Además, abundantes enterramientos medievales en la zona de la nave. La imagen 2 , muestra en fotografía antigua, de C. Enriquez de Salamanca, el aspecto de la cabecera del templo, tras desescombrar la cripta, cuya bóveda se había hundido; pero conservaba los arranques de nervaduras de crucería formada por dos arcos de medio punto dovelados. (Imagen 10 a 12 ). Centra el ábside de la cripta un ventanal rehundido, cegado, en funciones de hornacina (Imagen 13)La nave se cubre con medio cañón rebajado. Forma el arco triunfal una pareja de semicolumnas adosadas que sustentan fajón; con una evidente incoherencia en su lado sur (Imagen 1 ); la cual requirió un calzo de casi el mismo espesor que el fajón.
El presbiterio es amplio, conformando el arco triunfal los dos pares de semicolumnas mencionadas y su fajón. Los capiteles fueron repicados y destruida su decoración, quizá para acoplar un retablo (Imagen 3).
El lado norte presbiteral luce ventanal decorado, a base de arquivolta de baquetón y sendos capiteles con sus columnillas (Imagen 5). La misma hechura luce el vano que centra el ábside (Imagen 8). Los capiteles son sencillos en su decoración -muy desgastados- y solo destaco las dos toscar caritas afrontadas que hay en el del lado derecho del absidal (Imagen 6).
El lado sur del presbiterio posee un vano adintelado y aspillerado (Imagen 9). El cilindro absidal es de sencilla hechura, con la única decoración del ventanal. No hay imposta y cubre con cuarto de esfera.
La rehecha cripta es de planta cuadrada, hecho poco frecuente en estas estructuras, con bóveda de arista reforzada por recias nervaduras que son verdaderos arcos de medio punto dovelados apeados en basas en los ángulos
Se ha conservado en el lugar en que se halló el sarcófago antropomorfo que guardaba los restos de una dama sellados con cal. Todavía quedan restos de la misma, perfilando su cabeza y hombros (Imágenes 10 a 14)
La nave del templo se compone de dos tramos delimitados por fajón apeado en capiteles y semicolumnas adosadas al muro. Medio cañón corrido conforma la bóveda (Imagen 15).
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Al fondo de la nave, bien diferenciable por su revoque y bóveda de lunetos, el añadido del XV sobre el que se alza un coro alto.