La cabecera de la nave central se compone de ábside de tambor cubierto por cuarto de esfera e imposta biselada interpuesta. Por delante, profundo presbiterio cubierto de medio cañón. (Imagen 6)
En el lugar que ocupó la cúpula del crucero (Imagen 8), una decoración de crucería gótica, deja al descubierto las trompas que la sustentaban; permitiendo el paso del cuadrado al octógono. Sobre este lugar se eleva la torre mudéjar visible al exterior.
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La imagen 9 muestra una vista del transepto, desde su lado norte. En la imagen 10, una vista desde el altar de la nave central, que se cubre con bóveda apuntada; a diferencia de las laterales que lo hacen con medio cañón (Imagen 13).
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El ábside sur (Imagen 11), es similar al central, de menor tamaño y con un presbiterio menos amplio. Del ábside norte, demolido, solo queda su presbiterio (Imagen 12), en funciones de arco triunfal de paso a sala gótica poligonal, cubierta con bóveda de crucería.